注:以下所有樣本盡量新鮮!
1、動(dòng)物組織采集(樣本量盡量保證在綠豆大小,約200mg以上)
① 取材應(yīng)在冰上進(jìn)行,取材后組織用生理鹽水沖洗干凈,去除血漬和污物,并剔除非研究所需的組織;
② 吸干水漬并切小塊,放入已標(biāo)記的凍存管中,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
2、貼壁細(xì)胞RNA采集樣本(樣本量1*10^8以上)
RNA試劑盒法:
① 用微量移液器將細(xì)胞培養(yǎng)液吸除干凈,加入1ml 4℃預(yù)冷PBS溶液,輕搖洗滌;
② 將PBS吸除干凈后,再加入1ml PBS,用細(xì)胞刮收集細(xì)胞,3000rpm離心10min,棄去上清液,收集細(xì)胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存;
③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準(zhǔn)。提取樣本經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
Trizol法:
① 貼壁細(xì)胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,去除培養(yǎng)液;
② 每10c㎡培養(yǎng)面積加入1ml Trizol試劑;
③ 用1ml槍頭反復(fù)吹打,使Trizol與細(xì)胞充分接觸并消化;
④ 將上述溶液轉(zhuǎn)移到試管中,用一次性注射器(或者槍頭)反復(fù)吹打細(xì)胞,直至看不見成團(tuán)的細(xì)胞塊,使溶液呈現(xiàn)清亮且不粘稠的狀態(tài);
⑤ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
3、懸浮細(xì)胞RNA采集(樣本量1*10^8以上)
RNA試劑盒法:
① 懸浮細(xì)胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,3000rpm,離心10min,去除培養(yǎng)液;
② 收集細(xì)胞后,加入1ml 4℃預(yù)冷PBS溶液,輕搖洗滌,3000rpm,離心10min,棄去上清液,收集細(xì)胞沉淀,液氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存;
③ 使用RNA提取試劑盒提取RNA,具體提取方法以試劑盒說明書為準(zhǔn)。提取樣本經(jīng)氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱。
Trizol法:
① 懸浮細(xì)胞培養(yǎng)或處理結(jié)束后,離心收集細(xì)胞,去除培養(yǎng)液
② 保留的細(xì)胞用PBS快速洗一次,離心除去PBS;
③ 每1×10^6個(gè)細(xì)胞加1ml Trizol試劑,用一次性注射器進(jìn)行反復(fù)吹打直至看不見成團(tuán)的細(xì)胞塊,整個(gè)溶液呈清亮且不粘稠的狀態(tài);
④ 經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
4、血液樣本采集
全血樣本(以下方法步驟僅供參考)
哺乳動(dòng)物需要采集白細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn),(具體方法需參考各種分離液試劑說明書)
① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使血液與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立放置;
② 每1ml新鮮抗凝血中加入10ml紅細(xì)胞裂解液,輕輕吹打混勻,裂解4-5分鐘;
③ 加入20-30ml PBS、HBSS、生理鹽水或無血清培養(yǎng)液;
④ 2400rpm-2700rpm離心5分鐘,棄紅色上清;
⑤ 重復(fù)步驟③和步驟④,直至紅細(xì)胞裂解完全,收集細(xì)胞沉淀;
⑥ 每1×10^6個(gè)細(xì)胞加入1ml Trizol試劑,液氮速凍后,轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
5、血清樣本采集(備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴(kuò)增不出來)
① 用無抗凝劑血清管收集全血樣本,預(yù)留一定空間便于血清分離,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;
② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管(RNasefree)中;
③ 將分裝好的血清轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
6、血漿樣本采集(備注:因其RNA豐度很低,PCR可能擴(kuò)增不出來)
① 將新鮮全血收集于抗凝管中,上下輕輕顛倒幾次使之與抗凝劑充分混勻,置于4°C或冰盒中正立靜置10-20分鐘;
② 3000-3500rpm,離心10-15分鐘,取上清于離心管中;
③ 將分裝好的血漿轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存。
7、菌類(1*10^8 CFU以上的菌體)
液體培養(yǎng)基:
① 挑取單菌落于50ml液體培養(yǎng)基中,適宜溫度培養(yǎng)過夜,并在對數(shù)生長期進(jìn)行菌體采集;
② 培養(yǎng)好的菌液適量轉(zhuǎn)入合適的離心管中,高速離心收集菌體,棄去上層培養(yǎng)基,用封口膜封口后液氮速凍,轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存,大體積干冰運(yùn)輸;
固體或半固體培養(yǎng)菌種收集:
① 涂布平板培養(yǎng)的微生物,在菌體生產(chǎn)最旺盛時(shí)期刮下,置于1.5或2.0ml的離心管中,迅速液氮速凍。
② -80℃冰箱保存,轉(zhuǎn)運(yùn)至-80℃冰箱保存,大體積干冰運(yùn)輸。
樣本準(zhǔn)備注意事項(xiàng):
① 小體積的昆蟲類組織,如寄生蜂、螨等,可考慮用RNA保護(hù)劑進(jìn)行樣本收集,RNA保護(hù)劑的使用參照試劑說明書;
② 所有直接接觸樣本的試劑、耗材等物品均需要處于無RNA酶(RNasefree)環(huán)境;
③ 肝素會(huì)影響下游建庫測序,EDTA不適用于部分成分分析及PCR實(shí)驗(yàn),采集血液樣本時(shí)需根據(jù)檢測需求慎重選擇抗凝劑;
④ RNA樣本提取可采用RNA試劑盒、Tirzol法等,注意RNA樣本的純化,避免多糖多酚、蛋白和其它雜質(zhì)的殘留。提取完成后,提供Nanodrop、AGE或Agilent 2100中一種或多種形式的分析結(jié)果以判斷RNA的完整性、濃度、總量是否滿足需求。寄送TotalRNA的需注明提取所用的方法,如試劑盒或Tirzol法等;
⑤ 樣本標(biāo)簽勿粘貼在EP管或錫箔紙上,低溫下標(biāo)簽紙易脫落,建議使用記號筆標(biāo)記;
⑥ 細(xì)胞樣本不建議采用粘稠保護(hù)劑保存,否則將無法離心收集存放在保護(hù)劑的細(xì)胞樣本;
⑦ RNAlater、RNAstore等保護(hù)劑在25℃下能穩(wěn)定保存樣本3天,4℃保存樣本7天、-20℃條件下可長期保存樣本。建議用保護(hù)劑保存的樣本厚度不超過0.5cm。保護(hù)劑不適用于血液和液態(tài)樣本,組織樣本與保護(hù)劑的用量至少為1:10,RNAstore不適用于植物樣本保存。(不同保護(hù)劑保存時(shí)間有差異,具體以保護(hù)劑說明書為準(zhǔn));
⑧ Trizol為裂解液,不適用于組織樣本的保存,細(xì)胞除外。當(dāng)細(xì)胞存放在Trizol中需注明每管的細(xì)胞數(shù)量。
樣本寄送注意事項(xiàng):
① 樣本需要使用干冰進(jìn)行寄送,干冰消耗量為4-5kg/天(根據(jù)溫度會(huì)有所變動(dòng)),訂購量以快遞實(shí)際運(yùn)輸天數(shù)為準(zhǔn)(避開大型節(jié)假日及線上購物節(jié))。干冰采用厚實(shí)的泡沫箱進(jìn)行打包,外側(cè)用透明膠封好;
② 樣本寄送我司時(shí)需填寫《項(xiàng)目送樣單》。送樣單中樣本信息、數(shù)量、分組與編號需與實(shí)際保持一致,紙質(zhì)版送樣單隨樣本寄出,電子版送樣單及寄送快遞單號發(fā)送給公司,以便核對及備份數(shù)據(jù);
③ 在我司完成測序分析后,剩余樣本需要返還的項(xiàng)目,需在收到項(xiàng)目完整版結(jié)題報(bào)告3個(gè)月內(nèi)聯(lián)系我司進(jìn)行樣本返還,逾期樣本將進(jìn)行銷毀。如果樣本特別珍貴,需提前說明。樣本返回需要送樣方承擔(dān)返還費(fèi)用(包括干冰費(fèi)和快遞費(fèi));
④ 為確保實(shí)驗(yàn)的順利,送檢方需盡可能提供樣本,以防部分樣本降解重新取材、制備或送樣,耽誤檢測進(jìn)程。